Pedijatrijska klinika osnovana je 1947. godine pod rukovodstvom prof. dr. Milivoja Sarvana na lokalitetu „Jezero“ kao prva specijalizirana stacionarna ustanova za liječenje djece u Bosni i Hercegovini, sa kapacitetom od 60 kreveta. Nastavna djelatnost započela je 1949. godine na Medicinskom fakultetu, a potom i na Stomatološkom fakultetu, uz snažan fokus na edukaciju i stručno usavršavanje kadra.

Razvojem potreba Klinika se kontinuirano širila, dostigavši 1991. godine kapacitet od 250 postelja. Tokom rata 1992. godine premještena je na Koševo, a od 1996. godine djelovala je u privremenim prostorima. Od 2009. godine ponovo je smještena na lokalitet „Jezero“, gdje raspolaže savremenim kapacitetima i organizirana je kroz hospitalni i poliklinički segment.

Klinika zbrinjava pacijente iz cijele Federacije Bosne i Hercegovine i šire, primjenjujući savremene dijagnostičke i terapijske protokole, uz značajne rezultate u liječenju i edukaciji zdravstvenog kadra.